Ciri -ciri ketegangan (mikrob), pengenalan, pengasingan

A Ketegangan mikrob Ia adalah set keturunan dari satu mikroba terpencil, yang ditanam dalam medium tulen dan biasanya terdiri daripada penggantian organisma yang berasal dari koloni awal yang sama.

Ketegangan juga mewakili satu set individu dari populasi spesies mikrob yang berkongsi ciri -ciri fenotip dan/atau genotip tertentu yang sedikit membezakannya dari orang lain dari spesies yang sama, tetapi perbezaannya tidak mencukupi untuk mengkategorikannya sebagai spesies yang berbeza.

Gambar plat petri dengan medium budaya pepejal ditambah dengan antibiotik di mana mikrob tahan tumbuh (sumber: microrao/cc by-sa (https: // creativeCommons.Org/lesen/by-sa/4.0) melalui Wikimedia Commons)

Ketegangan adalah "asas" untuk sebarang kajian mikrobiologi, kerana ia menjamin saintis bahawa parameter dan ciri -ciri yang disiasat tentang sejenis mikroba hanya khusus untuk spesies tersebut. Di samping itu, ia membolehkan mereka memastikan, dengan cara yang sama, kebolehulangan penyiasatan.

Sebagai contoh, untuk kajian taksonomi dalam mikrobiologi, objektif pertama adalah untuk mendapatkan "ketegangan" organisma yang dikehendaki dari populasi satu jenis mikroba lain.

Ketegangan membolehkan anda menyimpan sejenis mikroba hidup dan terpencil In vitro Untuk jangka masa yang lama, iaitu, jauh dari persekitaran semula jadi. Anda boleh mendapatkan strain dari pelbagai mikroorganisma, seperti bakteria, kulat, virus, protozoa, alga, antara lain.

Untuk penyelenggaraan strain ini mesti dikekalkan dalam pengasingan yang ketat, yang mengelakkan ketegangan untuk bersentuhan dengan mana -mana ejen pencemar seperti spora kulat atau mana -mana ejen mikroorganisma luaran.

[TOC]

Ciri -ciri strain

Semua strain, tanpa mengira jenis mikroorganisma (spesies) yang mereka wakili, mesti memenuhi beberapa parameter asas, antaranya:

- Mereka mesti menjadi garis genetik yang stabil atau mempunyai kesetiaan genetik yang tinggi

Adalah penting bahawa semua individu yang tinggal di dalam medium budaya adalah sedekat mungkin di antara mereka, secara genetik. Iaitu, semuanya berasal dari individu yang sama atau, sekurang -kurangnya, dari penduduk yang sama.

Boleh melayani anda: Staphylococcus saprophyticus

- Mereka mesti mudah untuk mengekalkan atau menanam

Individu yang dimiliki oleh ketegangan semestinya mudah disimpan dalam persekitaran In vitro. Dengan kata lain, tidak semua mikrob dapat mengasingkan diri dari persekitaran semula jadi mereka. Jika ini sukar untuk ditanam di media luaran, biologi mereka dapat diubah dengan mudah dengan perubahan minimum dalam persekitaran di mana mereka tetap terpencil di makmal.

- Mereka perlu mempunyai pertumbuhan dan perkembangan yang pesat dalam keadaan yang optimum

Sekiranya mikrob terpencil tidak berkembang pesat dalam medium budaya yang digunakan untuk tujuan ini, ini sukar untuk dipelihara untuk kajian mereka, kerana mereka dapat membuang nutrien di persekitaran mereka, mengubah fasa atau berkompromi dengan kelangsungan hidup mereka dalam keadaan ini keadaan.

- Mereka mesti mengemukakan ciri dan parameter yang ditetapkan

Ketegangan mikroorganisma terpencil mesti mempunyai ciri -ciri umum yang berkaitan dengan identik dan khusus kepada individu yang sama dengan ini. Ciri -ciri ini mesti berterusan dari masa ke masa.

- Manipulasi mudah

Secara umum, strain yang digunakan dalam penyiasatan rutin tidak memerlukan alat atau protokol yang terlalu ketat atau rumit. Ini memastikan bahawa kedua -dua pelajar dan penyelidik baru dapat mengekalkan kesinambungan kajian dari masa ke masa.

ID

Pengenalpastian molekul

Terdapat kaedah yang berbeza untuk mengenal pasti ketegangan yang baru terpencil. Walau bagaimanapun, pada masa ini teknik yang paling tepat, cepat dan mudah untuk menentukan identiti hampir mana -mana spesies adalah analisis beberapa kawasan dari urutan genetik yang membentuk genom individu.

Biasanya analisis ini dijalankan menguatkan kawasan DNA tertentu dengan teknik PCR (tindak balas rantai polimerase). Teknik -teknik ini berbeza -beza mengikut kelebihan, keluarga dan jenis mikroorganisma yang anda ingin tahu identiti. Secara umum, kawasan ini adalah:

- Kawasan yang mengekodkan arns ribosomal

- Gen yang menyandarkan subunit protein yang mengambil bahagian dalam pernafasan (terutamanya jika organisma adalah aerobik)

- Rantau genetik yang mengkodekan untuk mikrofilam actin (sebahagian daripada sitoskeleton)

- Sesetengah kawasan genetik subunit chloroplast atau protein yang mengambil bahagian dalam fotosintesis (untuk beberapa alga dan sianobakteria dan untuk semua tumbuhan)

Boleh melayani anda: saprophytes

Sebaik sahaja serpihan genom ini berjaya diperkuatkan, mereka disusun untuk mengetahui susunan nukleotida yang membentuk kawasan genom ini. Ini dilakukan melalui teknik NGS (Bahasa Inggeris Penjujukan generasi seterusnya) Dengan pasukan khusus yang dikenali sebagai sequencers.

Kawasan yang disusun dibandingkan dengan urutan mikroorganisma jenis yang telah dilaporkan di atas, yang mungkin dengan menggunakan, sebagai contoh, pangkalan data yang disimpan di laman web GenBank (https: // www.NCBI.NLM.NIH.Gov/Genbank/).

Pengenalpastian morfologi

Di makmal yang tidak mempunyai alat biologi molekul untuk menganalisis ciri -ciri genetik parameter fenotip lain digunakan untuk mengenal pasti strain banyak mikroorganisma. Sekali lagi, ciri -ciri fenotip yang dikaji berbeza -beza bergantung kepada organisma, kelebihan, keluarga dan spesies yang dipertimbangkan. Antara parameter ini dikaji:

- Ciri -ciri morfologi mikrob dalam medium budaya. Ciri -ciri seperti: warna, bentuk, tekstur, jenis pertumbuhan, antara aspek lain diperhatikan.

- Analisis produk metabolik menggunakan alat biokimia. Pengeluaran metabolit sekunder, sebatian kimia yang dikeluarkan, antara lain, dikaji.

- Pencirian protein dan penghabluran. Protein dalaman dari mikroorganisma diekstrak dan dikaji secara bebas.

Perkara biasa dalam kajian mikrobiologi adalah untuk melaksanakan pencirian strain dengan kedua -dua jenis pengenalan, iaitu, melalui pemerhatian morfologi dan analisis molekul.

Penebat ketegangan

Penebat strain membayangkan beberapa teknik yang juga digunakan untuk memisahkan sejenis mikroba dari yang lain. Keupayaan untuk mengasingkan ketegangan sejenis minat adalah penting untuk menentukan ciri -ciri yang menentukannya.

Teknik pengasingan yang paling banyak dicipta pada abad kesembilan belas oleh ibu bapa Louis Pasteur dan Robert Koch Microbiology. Kedua -duanya berjuang dengan obsesif untuk mendapatkan budaya sel tulen (strain) mikroorganisma yang mereka pelajari.

Sumber: sentebrinka/cc oleh (https: // creativeCommons.Org/lesen/by/4.0) melalui Wikimedia Commons

Untuk mendapatkan budaya sel ini, mereka meneroka kepelbagaian teknik dan alat yang besar, dari penggunaan tongkat steril kepada variasi dalam komposisi media kultur di mana mikroba yang mereka pelajari sedang bersiap untuk berkembang.

Boleh melayani anda: Plasmodium malariae: Ciri -ciri, morfologi, kitaran hidup

Teknik penebat terikan

Pada masa ini, semua teknik yang dibangunkan dan digunakan oleh penyelidik ini dan beberapa yang lebih moden dalam 6 jenis yang berbeza, iaitu:

- Rayado, jalur atau calar: Menggunakan instrumen yang halus dan tajam, tempat di mana mikroorganisma terletak (khas untuk tanaman yang tumbuh In vitro dalam medium pepejal). Dengan yang melampau yang mana mikroorganisma berjalur disentuh, medium padat steril kaya dengan nutrien.

- Rendaman atau gabungan di tengah: Sampel kecil mikrob diambil (boleh seperti yang diambil dalam teknik sebelumnya) dan diletakkan di dalam medium pertumbuhan dalam keadaan cair, agar ditambah untuk menguatkan dan diharapkan dapat menyejukkan. Tanah jajahan hanya akan diperhatikan apabila mikroorganisma sangat maju.

- Pencairan bersiri: Sampel tempat asal dari mana spesies dicairkan terbentuk berturut -turut dalam medium steril yang bebas daripada mikroorganisma lain. Pencahatan itu "menyemai" dalam media pepejal dan koloni dijangka muncul.

- Media Budaya Eksklusif: Mereka adalah budaya bermakna yang membolehkan pertumbuhan hanya jenis mikroba yang menarik; iaitu, ia mempunyai komponen atau nutrien yang hanya membolehkan pertumbuhan ketegangan yang anda ingin mengasingkan.

- Pemisahan manual atau mekanikal: Sampel kecil mikrob yang dikehendaki untuk mengasingkan diletakkan dan melalui mikroskop satu individu dari spesies dari seluruh individu di sekelilingnya cuba memisahkan.

Beberapa teknik ini lebih mudah digunakan daripada yang lain. Walau bagaimanapun, penyelidik menggunakannya mengikut ciri -ciri biologi spesies kajian.

Rujukan

1. Daripada Kruif, p. (Sembilan belas sembilan puluh enam). Pemburu mikrob. Houchton Mifflin Harcourt.
2. Dijkshoorn, l., Ursing, b. M., & Ursing, J. B. (2000). Ketegangan, klon dan spesies: Komen mengenai tiga konsep asas bakteriologi. Jurnal Mikrobiologi Perubatan, 49 (5), 397-401.
3. Marx, v. (2016). Mikrobiologi: Jalan ke pengenalan tahap ketegangan. Kaedah Alam, 13 (5), 401-404.
4. Willey, J. M., Sherwood, l., & Wouretton, c. J. (2009). Prinsip Mikrobiologi Prescott. Boston (MA): Pendidikan Tinggi McGraw-Hill.
5. Williams, j. Ke. (Ed.). (2011). Kejuruteraan Terikan: Kaedah dan Protokol (Vol. 765, ms. 389-407). New York: Akhbar Manusia.