Ciri -ciri Genotip, Standard Reaksi, Penentuan

Dia Genotip Ia ditakrifkan sebagai set gen (dengan alel mereka) yang mereka encodkan untuk ciri atau ciri tertentu, yang dibezakan dari orang lain dengan fungsi atau urutan tertentu. Walau bagaimanapun, sesetengah penulis juga mentakrifkannya sebagai sebahagian daripada genom yang menimbulkan fenotip atau sebagai perlembagaan alel organisma.

Walaupun berkaitan, istilah genotip dan fenotip bukan perkara yang sama. Dalam pengertian ini, fenotip ditakrifkan sebagai set ciri -ciri yang kelihatan dari organisma yang merupakan hasil dari ekspresi gennya, dan kepada genotip sebagai set gen yang menghasilkan fenotip tertentu.

Genotip dan fenotip (Sumber: Institut Penyelidikan Genom Manusia Kebangsaan [Domain Awam] melalui Wikimedia Commons) Genotip hanya salah satu faktor yang terlibat dalam penubuhan fenotip, kerana pengaruh alam sekitar dan unsur -unsur epigenetik lain yang tidak berkaitan secara langsung ke urutan nukleotida juga membentuk ciri -ciri individu yang kelihatan.

Oleh itu, dua organisma mempunyai genotip yang sama jika mereka berkongsi set gen yang sama, tetapi yang sama tidak benar untuk dua organisma yang nampaknya berkongsi fenotip yang sama, kerana ciri -ciri yang sama dapat menjadi hasil dari gen yang berbeza.

Ia adalah ahli botani Denmark Wilhelm Johansen, pada tahun 1909, yang mula -mula memperkenalkan ke dalam sains istilah genotip dan fenotip, dalam buku teks yang dia bertajuk "Unsur -unsur teori mengenai warisan yang tepat ", yang merupakan produk dari satu siri eksperimen yang dilakukan melintasi garis murni barli dan kacang polong.

Karya -karyanya, mungkin diilhamkan oleh mereka yang dibuat beberapa tahun sebelumnya oleh Gregorio Mendel, dianggap sebagai "Bapa genetik", Membenarkannya menjelaskan bahawa genotip organisma menimbulkan fenotip melalui proses pembangunan yang berbeza dan di bawah pengaruh alam sekitar.

[TOC]

Ciri -ciri

Genotip tidak sama seperti genom. Berikut adalah perbezaan antara kedua -dua konsep:

- "Genom" merujuk kepada semua gen yang telah diwarisi oleh individu dari ibu bapa mereka dan bagaimana mereka diedarkan dalam kromosom dalam nukleus.

- "Genotip" adalah istilah yang digunakan untuk merujuk, sebagai contoh, kepada set gen dan varian mereka yang menimbulkan ciri tertentu, bahawa individu dibezakan dalam populasi atau spesies.

Walaupun ia terdedah kepada perubahan yang disebabkan oleh mutasi sepanjang sejarah penting organisma, genotip adalah ciri individu yang agak tidak terhingga, kerana, secara teori, gen yang diwarisi adalah sama dari konsepsi hingga mati.

Dalam populasi semulajadi, alel yang membentuk genotip yang diberikan mempunyai frekuensi penampilan yang berbeza; Iaitu, ada yang muncul dalam populasi lebih daripada yang lain dan ini berkaitan, antara beberapa perkara, dengan pengedaran, keadaan persekitaran, kehadiran spesies lain, dll.

Istilah "genotip liar"Mendefinisikan varian allelic pertama yang terdapat dalam alam semula jadi, tetapi tidak semestinya merujuk kepada alel yang dijumpai lebih kerap dalam populasi; dan istilah "genotip Mutant"Ia kini digunakan untuk menentukan alel yang berbeza dari alam liar.

Untuk menulis genotip, huruf besar dan huruf kecil biasanya digunakan, untuk membezakan antara alel yang dimiliki oleh individu, sama ada homozigotik atau heterozigot. Huruf modal digunakan untuk menentukan alel dominan dan huruf kecil untuk resessive.

Peraturan tindak balas genotip

Individu mewarisi gen ibu bapa mereka, tetapi bukan produk akhir yang diperoleh dari ekspresi mereka, kerana mereka bergantung pada banyak faktor luaran dan sejarah perkembangan mereka.

Menurut ini dan merujuk hanya kepada faktor persekitaran, genotip boleh membawa kepada lebih daripada satu fenotip. Set kemungkinan "hasil" interaksi genotip tertentu dengan persekitaran yang berbeza adalah apa yang disebut saintis "peraturan reaksi genotip".

Norma tindak balas genotip adalah, maka, sejenis "kuantifikasi" atau pendaftaran ciri -ciri yang dapat dilihat dari interaksi genotip dengan persekitaran tertentu. Ia boleh dinyatakan sebagai grafik atau jadual yang "meramalkan" hasil yang mungkin.

Sudah tentu, jelas bahawa standard tindak balas hanya merujuk kepada genotip separa, fenotip separa dan beberapa faktor persekitaran, kerana dalam praktiknya sangat sukar untuk meramalkan semua interaksi dan semua hasilnya.

Bagaimana genotip ditentukan?

Tentukan genotip atau "genotif" organisma atau populasi individu spesies yang sama, memberikan banyak maklumat berharga mengenai biologi evolusi, biologi penduduknya, taksonomi, ekologi dan kepelbagaian genetiknya.

Dalam mikroorganisma seperti bakteria dan ragi, kerana mereka mempunyai kadar pendaraban dan mutasi yang lebih tinggi daripada kebanyakan organisma multiselular, menentukan dan mengetahui genotip membolehkan untuk mengawal identiti koloni dalam koleksi, serta menubuhkan beberapa ciri epidemiologi, ekologi dan taksonomi yang sama.

Untuk menentukan genotip adalah perlu untuk mendapatkan sampel organisma yang anda ingin bekerja, dan jenis sampel yang diperlukan bergantung pada setiap organisma. Pada haiwan, sebagai contoh, sampel tisu yang berbeza boleh diambil: ekor, telinga, najis, rambut atau darah.

Genotip organisma dapat ditentukan secara eksperimen terima kasih kepada penggunaan beberapa teknik moden, yang bergantung kepada lokasi genomik gen untuk belajar, belanjawan dan masa, kemudahan penggunaan dan tahap prestasi yang dikehendaki.

Pada masa ini, teknik yang digunakan untuk genotipifikasi organisma termasuk, sangat kerap, penggunaan dan analisis penanda molekul untuk mengesan polimorfisme dalam DNA dan teknik lain yang lebih maju yang menyiratkan penjujukan genom.

Lebih banyak penanda pekerja

Antara penanda yang paling banyak digunakan, kami dapati perkara berikut:

- RFLPS (polimorfisme serpihan sekatan).

- AFLPS (Polimorfisme Panjang Serpihan Diperkuatkan).

- Rapds (DNA polimorfik secara rawak).

- Microsatellites atau SSRS (urutan mudah berulang).

- ASAP (primer yang dikaitkan dengan alel tertentu).

- SNP (polimorfisme nukleotida mudah).

Teknik yang menggunakan penjujukan dan hibridisasi

Dan di antara teknik yang menggunakan penjujukan dan hibridisasi spesifik probe tertentu adalah:

- Penjujukan oleh kaedah Sanger.

- Genotipifikasi prestasi tinggi.

- Latihan "Goldengate"Dari Illumina.

- Penjujukan genotipifikasi (GBS).

- Taqman Essay.

- Penjujukan generasi baru.

- Microarrers.

- Penjujukan genom penuh.

Rujukan

1. Griffiths, a., Wessler, s., Lewontin, r., Gelbart, w., Suzuki, d., & Miller, J. (2005). Pengenalan kepada Analisis Genetik (8th ed.). Freeman, w. H. & Syarikat.
2. Klug, w., Cummings, m., & Spencer, c. (2006). Konsep genetik (8th ed.). New Jersey: Pendidikan Pearson.
3. Kwok, ms.-Dan. (2001). Kaedah untuk genotip polimorfisme nukleotida tunggal. Annu. REV. Genomik hum. Genet., 2(11), 235-258.
4. Mahner, m., & Kary, m. (1997). Apa sebenarnya genom, genotip dan fenotip? Dan bagaimana dengan fenomes ? J. Theor. Biol., 186, 55-63.
5. Mueller, u. G., & Wolfenbarger, l. L. (1999). Genotyping dan cap jari AFLP. Pokok, 14(10), 389-394.
6. Institut Kesihatan Kebangsaan. Diperoleh pada 14 Mei 2019, dari www.NIH.Gov/
7. Patel, d. Ke., Zander, m., Dalton-Morgan, j., & Batley, J. (2015). Kemajuan dalam genotip tumbuhan: di mana masa depan akan membawa kita. Dalam j. Batley (ed.), Genotyping Loji: Kaedah dan Protokol (Vol. 1245, ms. 1-11). New York: Springer Science + Business Media, New York.
8. Pierce, b. (2012). Genetik: Pendekatan Konseptual. Freeman, w. H. & Syarikat.
9. Schleif, r. (1993). Genetik Biologi dan Molekul (Edisi ke -2.). Maryland: The Johns Hopkins University Press.
10. Tümmler, b. (2014). Kaedah Genotyping. Didalam. Filloux & J. L. Ramos (eds.), Kaedah dalam Biologi Molekul (Vol. 1149, ms. 33-47). New York.
11. Yang, w., Kang, x., Yang, q., Lin, dan., & Fang, m. (2013). Semak mengenai perkembangan kaedah genotip untuk menilai kepelbagaian haiwan ladang. Jurnal Sains Haiwan dan Bioteknologi, 4(2), 2-6.